Viron kansallismuseo Tartossa on ehdottomasti Viron suurin, tarjoten 6000 neliömetriä näyttelytilaa. Sisältö on kuitenkin museon kokoa tärkeämpi asia.

Suurin osa näyttelyalasta on omistettu näyttelylle nimeltä "Kohtaamisia", joka esittelee Viron kulttuurihistoriaa ja jokapäiväistä elämää nykyisyydestä jääkauteen.

Toiseksi suurin pysyvä näyttely on nimeltään "Uralin kaiku". Näyttelyssä kävijä saa tietoa erilaisten, suomalais-ugrilaisten kansojen elämästä ja maapallon pohjoisen osan asuttamisesta. Näyttelyssä kuljetetaan läpi neljän vuodenajan esitellen viron sukulaiskansoihin kuuluvia ihmisiä.

Vaihtuvien näyttelyiden halli (900 m2) avattiin helmikuussa 2017 ja näyttelyt vaihtuvat vuosittain. Kesäkuussa 2017 avattiin suurin viron kansallispukuja esittelevä näyttely. 2018, avataan Viron satavuotisjuhlanäyttely, joka on koottu Viron eri museoista. Näyttely kertoo yhteiskunnan muutoksista Virossa vuosien 1987 ja 1994 välillä.

Pienempiä näyttelyitä löytyy Raadin kartanon mailta, jolla Viron kansallismuseo sijaitsee. Myös Heimtalin museossa Viljandissa on kansallismuseon näyttely. Kiertävät näyttelyt ja virtuaalinäyttelyt lisätään ohjelmistoon tulevaisuudessa.

Vireon Kansallismuseon näyttely ”Olipa kerran…tarina satujen synnystä” on avautuu Vapriikissa (Suomi, Tampere). Se on näyttely saduista, sankareista ja sankarittarista. Näyttely on avoinna 10.3.2024 asti.